珀尔修斯
任何医疗保健数据在用于分析之前都需要转换为通用格式. OMOP公共数据模型(CDM)有助于将不同的数据源组织到相同的关系数据库设计中. 然而, 提取, 转换和加载(ETL)过程可能很困难，通常需要强大的技术知识和领域专业知识.
珀尔修斯是一个软件解决方案，通过提供灵活且易于使用的可视化环境来简化CDM转换. 将数据转换为OMOP格式并不需要很强的技术知识. 通过一个可理解的三步过程执行所需的转换:预处理, 映射和转换.
工作原理
好处
透明度
可视化界面通过不同的操作引导用户
可实时查看转换过程, 如果发生错误，可以快速做出反应
可以查看所有转换运行的摘要和状态
可重用性
类似字段的自动映射，防止用户每次都从头开始
自动生成CDM字段的字段值
用户可以利用内置的源到源和源到标准词汇表查找
可靠性
数据质量检查测试数据是否符合给定的需求
App与观察健康数据科学和信息学(OHDSI)社区使用的工具集成, 其中包括大白兔, Rabbit-in-a-Hat, Usagi, 雅典娜和数据质量仪表盘
Time & 成本效益
减少花在手工处理上的时间，例如编码源数据并将其映射到目标系统
与传统的转换项目相比，更少的人需要参与这个过程
一般工作流程
预处理
预处理
导入数据资产(e.g. 大白兔扫描报告或扫描DB)
合并源表
审核并确认数据
映射
映射
保存映射并打开现有映射
为concept_id字段创建自定义查找
将源映射到目标表/字段
搜索新代码和OMOP标准概念之间的映射
设置转换和词汇表查找
定义创建时代的逻辑(DRUG_ERAs, CONDITION_ERAs等).)
定义分组访问发生/观察周期记录的逻辑
创建一个ETL规范文档
转换
转换
将源转换为CDM
查看转换进度
查看转换运行结果
导出结果以进行离线审查和进一步分析
申请演示
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